牙本质龋中，小管内有大量钙盐沉积的区域为A、坏死崩解层B、细菌侵入层C、脱矿层D、透明层E、脂肪变性层

细菌侵入层在脱矿层表面。细菌侵入小管并繁殖，有的小管被细菌所充满，小管扩张呈串珠状。小管壁脱矿，随后有机物基质被蛋白溶解酶分解，小管相互融合形成大小不等的坏死灶。

此题为牙本质龋病理变化特点的分析题。牙本质龋最深层、最早出现的改变位于病变的底部和侧面，在透射光下呈均质透明状。这种透明是由于牙本质小管管腔变窄、管腔中有矿物盐沉积，使管腔内折光率与周围细胞间质相似所致。矿物晶体可先沉积于成牙本质细胞突起内，也可先出现于细胞突周围呈向心性沉积。以后，晶体数量逐渐增多，最终可将小管完全堵塞。备选答案中其他选项的层次不具备这些改变，因此正确答案应选D。

透明层又称硬化层，牙本质龋最深层、最早出现的改变，是由于牙本质小管管腔变窄、管腔中有矿物盐沉积，使管腔内折光率与周围细胞间质相似造成的。