根据中国证监会的有关规定，上市公司的下列事项中，独立董事应当发表独立意见的有（ ）。A.公司董事的提名B.公司监事的任免C.公司高级管理人员的薪酬D.公司内部管理机构的设置

Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ项，《关于在上市公司建立独立董事制度的指导意见》第6条规定，独立董事应当对以下事项向董事会或股东大会发表独立意见：①提名、任免董事；②聘任或解聘高级管理人员；③公司董事、高级管理人员的薪酬；④上市公司的股东、实际控制人及其关联企业对上市公司现有或新发生的总额高于300万元或高于上市公司最近经审计净资产值的5%的借款或其他资金往来，以及公司是否采取有效措施回收欠款；⑤独立董事认为可能损害中小股东权益的事项；⑥公司章程规定的其他事项。
Ⅳ项，上市公司股权激励的下列事项需独立董事发表意见：①股权激励计划草案；②在向激励对象授出权益前，董事会就设定的激励对象获授权益的条件是否成就进行审议；③向激励对象授出权益与股权激励计划的安排存在差异；④激励对象在行使权益前，董事会就设定的激励对象行使权益的条件是否成就进行审议；⑤变更股权激励计划。
Ⅴ项，对上市公司对外担保，董事会审议对外担保事项时，上交所不强制要求独立董事发表意见；深交所强制要求独立董事发表意见，对合并范围内子公司提供担保的除外。

独立董事对公司关联交易、聘用或者解聘会计师事务所等重大事项进行审核并发表独立意见。就上市公司董事、高级管理人员的提名、任免、报酬、考核事项以及其认为可能损害中小股东权益的事项发表独立意见。

独立董事就上市公司董事、高级管理人员的提名、任免、报酬发表独立意见，对监事任免和内部机构设置不发表独立意见。因此，B、D不属于发表独立意见的内容。